尿液生物标志物发现

尿液生物标志物

尿液中蕴含着丰富的蛋白质、代谢产物等生物分子。由于不受稳态机制的严格调控,尿液可以更早地反映身体健康状态的变化,兼之其在临床实践中可以被无创、大量、重复地采集,因此是理想的生物标志物来源。
 

经过多年研究积累,我们针对尿液生物标志物发现的需求,已经建立了涵盖组学实验、数据分析、数据管理和AI辅助知识发现的一整套研发体系。

主要成果

尿液蛋白质组鉴定

我们建立了基于质谱的高通量深度尿液蛋白质组鉴定平台,对正常人和多种疾病的尿蛋白质组学特征进行了深度研究。在正常人的尿液中鉴定了超过6000种蛋白质,发现了除泌尿系统外,大脑、肝脏等各种系统高表达的蛋白,提示尿蛋白的变化可反映全身不同器官的病理生理.变化(Sci Rep. 2017;7(1):3024.)。

生物标志物AI建模

结合生物信息分析和多种机器学习算法,搭建了候选生物标志物筛选和模型参数优化、多模型集成、效果评价的工作流。

研究案例:结肠癌诊断和转移的尿蛋白生物标志物发现(Nat Commun. 2022 May 19;13(1):2757. )。

尿液生物标志物数据库

通过AI算法和领域专家的通力合作,建立了国际上唯一一个持续更新的尿液生物标志物数据库。该数据库从文献中的提取最新发表的潜在生物标志物信息,为研究者掌握行业现状和进行深入数据挖掘提供了宝贵的资源(Mol Cell Proteomics. 2011 Nov;10(11):M111.010975.;Urine, 2019, p. 65-72.)。

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