生物医学知识图谱
知识图谱是一种将概念及其相互关系以结构化形式呈现的语义网络，是支撑生物医学信息学科研与应用的重要基础设施，主要应用于跨领域知识融合、复杂知识查询以及知识推理等方面。
相较于大语言模型，知识图谱在精准的知识表示、可解释的推理过程以及便捷的更新迭代等方面展现出显著优势。
我们与中国医学科学院基础医学研究所合作构建了BMKG生物医学知识图谱。目前，我们正致力于结合知识图谱与大语言模型两种AI算法，在增强知识检索、知识辅助数据分析和新知识发现等领域展开研究。
BMKG
生物医学知识图谱（Biomedical Knowledge Graph，BMKG）是一个知识图谱和网站应用，整合了13个生物医学本体和数据库，以及各种图算法。BMKG涵盖疾病、表型、基因、蛋白、通路、药物、人体解剖结构等9种类型的实体，共包括2,508,348个节点和20种类型的25,362,594个关系。
BMKG应用
知识检索
应用BMKG的图检索功能，可一次性检索来源于13个生物医学本体和数据库的知识，高效地获取跨不同数据源实体之间的关联关系。
数据注释
对给定的基因/蛋白列表，通过元路径检索从BMKG中抽取其相关的疾病、表型、通路等节点，构建子图用于基因/蛋白的功能注释，支撑进一步数据分析。
图分析算法
集成图嵌入、路径发现、模块发现等图算法，从从知识图谱的语义近似性和拓扑结构等方面对BMKG进行探索性分析，可用于发现新的科学假说。